体DNA分子与外源DNA分子摩尔数为1∶1~5∶1)补足ddH2O 至8μl。
3.轻轻混匀稍加离心,56℃水浴5min后迅速转入冰浴。
三、DNA聚合酶及其应用
(一)大肠杆菌DNA聚合酶I
是Kornberg A. 1956年首先从大肠杆菌EColi 細胞中分离出来的。它是一种多功能性的酶包括3种不同的酶活力:
A.5′→3′聚合酶活性(模板,带3′-OH游离基团的引物、4dNTPs、Mg2+ )
B.双链特异性的5'→3'核酸外切酶活性。
C.3'→5'核酸外切酶活性
从游离的双链或单链DNA的3′端降解。不过对于双链的降解可被5′-3′的多聚活性所抑制主要是校正作用。
大肠杆菌DNA聚合酶I 的三种用途
1.利用缺口转移法制备高比活度的DNA针
利用其5′--3′的外切酶活性及其聚合酶活性
2.用于DNA连接前的大缺口填充
利用5′--3′的聚合酶活性。
3.用于DNA的序列分析
利用5′--3′的聚合酶活性
Klenow片段是大肠杆菌聚合酶I 全酶经枯草杆菌蛋白酶处理后产生的大片段酶分子,分子量为76KD
酶催活性:⑴5’ →3’ 的聚合酶活性
⑵3’ →5’ 的核酸外切酶活性
Klenow片段的主要用途(利用5’ →3’ 的聚合酶活性):
⑴修补限制性酶消化DNA形成的3′隐蔽末端
⑵标记DNA片段的末端
⑶cDNA克隆中第二链cDNA的合成
T4DNA聚合酶是从T4噬菌体感染了的大肠杆菌中分离出来的,
⑴5′→3′的聚合酶活性
⑵3 ′→ 5 ′的核酸外切酶活性其外切酶活性要比大肠杆菌聚合酶I 的活性高200倍。比Klenow 片段酶强100~1,000倍
因此,可以综合利用这两种活性进行取代合成反应:
如果反应体系中仅存在一种dNTP或没有底物时这时T4DNA聚合酶就会表现出3 ′→5 ′外切酶活力,从双链DNA的3′开始降解直到露出底物dNTP相同的碱基。然后就在此位置发生合成和取代反应
(1)利用取代合成反应制备针
产品特点:1. 5′→3′DNA聚合酶活性泹不具有5′→3′外切核酸酶活性,因此没有纠错功能
2. 嗜温性,最适反应温度为68℃建议反应温度不要超过70℃。
3. 强链置换能力可以用于DNA鏈置换反应和LAMP扩增。还可用于68℃DNA测序(该条件尤其适用于富含GC的模板和纳克级的模板)
4. 不能用于热循环测序或PCR,80℃ 10分钟即可失活